此次專項治理鎖定2018年1月—2020年5月，分為單位自查、規范整改、審核檢查、總結驗收四個步驟，查找在財務管理、資金使用中存在的問題，重大事項可以追溯到以前年度。對行政事業單位，治理重點為費用報銷、資金資產管理和內部控制;對國有企業，則從費用報銷、資金管理、重大財務事項、內部控制方面進行檢查。兩部門明確，區縣可結合當地實際情況，增加專項治理的內容和事項。
據介紹，財政、國資部門將一手抓整改糾正問題，形成有針對性、操作性的整改措施;一手抓建立長效機制，不斷強化制度的剛性約束，切實提高資金使用效益。通過專項治理，著力解決行政事業單位、國有企業在財務管理、資金使用、資產管理等方面的突出問題，完善內控制度體系，嚴肅財經紀律，促進各單位履行好財務管理主體責任和監管責任，堵塞管理漏洞，切實把“錢袋子”管住管好，從源頭斬斷滋生腐敗和不正之風的通道。
為了把專項治理做深做實，財政、國資部門還建立與人大、紀檢監察、審計等部門的協同聯動機制，對接受檢查不配合，自查整改不到位，以及搞形式、走過場、敷衍應付的，將嚴肅追責。對專項治理中發現的違法違紀線索，將及時移送相關部門。
